1999年原市卫生防疫站取得国家技术监督局颁布的计量认证合格证[(99)量证(闽)字(L0217)号], 2005年市疾病预防控制中心顺利通过了省级计量认证复评审。
莆田市疾控中心尿碘实验室、盐碘实验室为2007年参加全国质控网络并合格的实验室
莆田市疾控中心荣获福建省卫生厅批准设立艾滋病检测确证实验室
2012年7月莆田市疾病预防控制中心顺利通过了省级计量认证复评审
2012年7月莆田市疾病预防控制中心顺利通过了省级食品检验机构资质认证复评审